醫(yī)院創(chuàng)建于1961年，前身為浙江中醫(yī)學(xué)院門診部，時(shí)為浙江中醫(yī)學(xué)院唯一的臨床教學(xué)基地，被中醫(yī)界譽(yù)為“浙江省名中醫(yī)的搖籃”。2003年，門診部與原浙江中醫(yī)學(xué)院針推系“院系合一”，成立浙江中醫(yī)學(xué)院針灸推拿醫(yī)院，并于2006年隨大學(xué)升格更名為浙江中醫(yī)藥大學(xué)附屬第三醫(yī)院。2008年底，醫(yī)院與原浙江省郵電職工醫(yī)院合并重組，轉(zhuǎn)型為綜合性中醫(yī)醫(yī)院。2009年，加冠浙江省中山醫(yī)院。

醫(yī)院現(xiàn)有職工1057人，高級(jí)職稱132人，其中衛(wèi)生部和浙江省有突出貢獻(xiàn)中青年專家1人、中醫(yī)藥高等學(xué)校教學(xué)名師1人、浙江省衛(wèi)生領(lǐng)軍人才1人、全國(guó)老中醫(yī)藥專家學(xué)術(shù)經(jīng)驗(yàn)繼承指導(dǎo)老師6人、浙江省名中醫(yī)4人、浙江省杰出青年基金獲得者1人、浙江省衛(wèi)生創(chuàng)新人才1人、浙江省151人才9人。此外，醫(yī)院還擁有核磁共振（MRI）、64排螺旋CT、DSA、PCR儀、全自動(dòng)生化分析儀、彩色超聲診斷系統(tǒng)等大型現(xiàn)代化醫(yī)療設(shè)備，為醫(yī)教研協(xié)調(diào)發(fā)展提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

醫(yī)院堅(jiān)持“中醫(yī)為本、西醫(yī)為用、差異化發(fā)展”的辦院理念，保持和發(fā)展中醫(yī)特色，積極追蹤現(xiàn)代醫(yī)學(xué)治療手段，形成了50個(gè)特色鮮明、療效明顯的專科專病專技群，其中國(guó)家臨床重點(diǎn)專科3個(gè)，國(guó)家中醫(yī)藥重點(diǎn)專科5個(gè)，中風(fēng)病、面痛癥、肩凝癥、髖關(guān)節(jié)功能障礙、腰椎間盤突出癥、胸椎錯(cuò)縫、眩暈病、冠心病、慢阻肺、不孕不育、甲乳疾病、惡性腫瘤等多個(gè)優(yōu)勢(shì)病種的療效達(dá)到全國(guó)先進(jìn)水平。依托浙江名中醫(yī)館的名中醫(yī)優(yōu)勢(shì)，積極開展名老中醫(yī)學(xué)術(shù)思想、臨證經(jīng)驗(yàn)、獨(dú)有技術(shù)的傳承與創(chuàng)新，設(shè)立我省首個(gè)經(jīng)方醫(yī)學(xué)研究會(huì)，擁有陳木扇女科全國(guó)流派傳承工作室和5個(gè)全國(guó)名老中醫(yī)傳承工作室。醫(yī)院積極探索多學(xué)科聯(lián)合診療模式，獲批成立浙江省椎間盤診療中心，并被國(guó)家中醫(yī)藥管理局列為中醫(yī)診療模式創(chuàng)新試點(diǎn)單位。以中醫(yī)護(hù)理為特色的護(hù)理團(tuán)隊(duì)也在全省頗有影響力。

醫(yī)院堅(jiān)持“中醫(yī)為本、西醫(yī)為用、差異化發(fā)展”的辦院理念，保持和發(fā)展中醫(yī)特色，積極追蹤現(xiàn)代醫(yī)學(xué)治療手段，形成了50個(gè)特色鮮明、療效明顯的專科專病專技群，其中國(guó)家臨床重點(diǎn)專科3個(gè)，國(guó)家中醫(yī)藥重點(diǎn)專科5個(gè)，中風(fēng)病、面痛癥、肩凝癥、髖關(guān)節(jié)功能障礙、腰椎間盤突出癥、胸椎錯(cuò)縫、眩暈病、冠心病、慢阻肺、不孕不育、甲乳疾病、惡性腫瘤等多個(gè)優(yōu)勢(shì)病種的療效達(dá)到全國(guó)先進(jìn)水平。依托浙江名中醫(yī)館的名中醫(yī)優(yōu)勢(shì)，積極開展名老中醫(yī)學(xué)術(shù)思想、臨證經(jīng)驗(yàn)、獨(dú)有技術(shù)的傳承與創(chuàng)新，設(shè)立我省首個(gè)經(jīng)方醫(yī)學(xué)研究會(huì)，擁有陳木扇女科全國(guó)流派傳承工作室和5個(gè)全國(guó)名老中醫(yī)傳承工作室。醫(yī)院積極探索多學(xué)科聯(lián)合診療模式，獲批成立浙江省椎間盤診療中心，并被國(guó)家中醫(yī)藥管理局列為中醫(yī)診療模式創(chuàng)新試點(diǎn)單位。以中醫(yī)護(hù)理為特色的護(hù)理團(tuán)隊(duì)也在全省頗有影響力。